Роль электростатических взаимодействий в формировании комплекса между бактериальной люциферазой и NADPH:FMN-оксидоредуктазой
View/ Open:
URI (for links/citations):
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/67842Author:
Деева, А.А.
Немцева, Е.В.
Кратасюк, В.А.
Deeva, Anna A.
Nemtseva, Elena V.
Kratasyuk, Valentina A.
Date:
2018Journal Name:
Журнал Сибирского федерального университета. Биология. Journal of Siberian Federal University. Biology; 2018 11 (1)Abstract:
Методом молекулярного докинга исследован возможный механизм формирования белкового
комплекса между бактериальной люциферазой и NADPH:FMN-оксидоредуктазой из Vibrio
harveyi за счет электростатических взаимодействий. Комплекс между исследуемыми
ферментами необходим для передачи люциферазе субстрата – молекулы FMNH2, которая
подвержена быстрому автоокислению с образованием активных форм кислорода при контакте
с внутриклеточным растворителем. В настоящей работе с помощью метода Монте-
Карло было получено многообразие возможных положений NADPH:FMN-оксидоредуктазы
относительно люциферазы с учетом потенциала электростатического поля, создаваемого
люциферазой. Показано, что среди структур с наименьшей энергией взаимодействия имеется
комплекс, в котором ориентация активных центров обоих ферментов способствует прямой
передаче флавина. Высказано предположение о роли водородной связи между Arg291 и Gln197
люциферазы и оксидоредуктазы соответственно в стабилизации комплекса между белками A possible mechanism of complex formation between bacterial luciferase and NADPH:FMNoxidoreductase
from Vibrio harveyi sustained by electrostatic forces is studied. The complex between
the enzymes is important for a direct FMNH2 transfer without a contact with solvent, which could
cause a rapid autooxidation and the formation of reactive oxygen species. In the current work the
diversity of possible relative positions of NADPH:FMN-oxidoreductase and luciferase was obtained
with Monte-Carlo sampling governed by oxidoreductase internal charged groups and electrostatic
field caused by luciferase. Among the structures with the minimal energies, the one was found that
has a proper active sites orientation for a direct FMNH2 transfer. Possible role of hydrogen bonding
between Arg291 and Gln197 of luciferase and oxidoreductase, respectively, in stabilization of this
complex is proposed
Collections:
Metadata:
Show full item recordRelated items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Bioluminescent System of Luminous Bacteria for Detection of Microbial Contamination
Kirillova, Maria A.; Esimbekova, Elena N.; Ranjan, Rajeev; Torgashina, Irina G.; Kratasyuk, Valentina A.; Кириллова, М.А.; Есимбекова, Е.Н.; Ранджан, Р; Торгашина, И.Г.; Кратасюк, В.А. (Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University, 2018-06)Microbial contamination is usually analyzed using luciferin-luciferase system of fireflies by the detection of adenosine-5’-triphosphate (ATP). There is an opportunity to assess the bacterial contamination of various ... -
Температурная инактивация биферментной системы светящихся бактерий NADH:FMN-оксидоредуктаза-люцифераза в желатине
Безруких, А.Е.; Bezrukikh, Anna E.; Есимбекова, Е.Н.; Esimbekova, Elena N.; Кратасюк, В.А.; Kratasyuk, Valentina A. (Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University., 2011-03)Исследовано влияние желатинового раствора и геля на биолюминесценцию биферментной системы светящихся бактерий NADH:FMN-оксидоредуктаза-люцифераза, изучены термостабильность и температурная инактивация биферментной системы ... -
Оптимизация состава многокомпонентного иммобилизованного реагента
Помытника, Татьяна Дмитриевна (Сибирский федеральный университет, Красноярск, 2021)Итогом данного исследования стал подобранный оптимизированный состав многокомпонентного иммобилизованного реагента на основе биолюминесцентной ферментативной системы светящихся бактерий, содержащий 0,12 мкг люциферазы и ... -
Перспективы использования биолюминесцентного метода тестирования слюны в оценке уровня тренированности спортсменов
Колесник, Ольга Владиславовна (Сибирский федеральный университет, Красноярск, 2017)Выпускная бакалаврская работа «Перспективы использования биолюминесцентного метода тестирования слюны в оценке уровня тренированности спортсменов» посвящена использованию биолюминесцентной ферментативной системы ... -
Минеральные ресурсы Мирового океана – прагматическая реальность обозримого будущего или призрачный геополитический мираж
Андреев, С.И.; Бабаева, С.Ф.; Andreev, Sergei I.ru_RU; Babaeva, Svetlana F. (Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University., 2014-08)Изложено состояние изученности твердых полезных ископаемых Мирового океана (ЖМК, КМК, ГПС), дана оценка возможного вклада в минерально-сырьевую базу страны. Отмечается, что проблема минеральных ресурсов океана уже в ...