Magnetic Particles as a Carrier to Select Aptamer for Survivin (BIRC5), a Low Molecular Weight Protein Tumor Marker

Abstract

Magnetic iron oxide nanoparticles modified with aminosiloxane ( -Fe2O3@SiO2-NH2) were used as a carrier to select DNA aptamers for a small protein tumor biomarker survivin (BIRC5, 16.5 kDa) from a randomized synthetic DNA library by the SELEX method. Survivin was covalently immobilized on the nanoparticles’ surface. The library enrichment was monitored by solid-phase bioluminescent immunoassay and the DNA melting method. The prospects are outlined for the use of the obtained nanoparticles for the effective selection of aptamers specific to a given target

Магнитные наночастицы оксида железа модифицированные аминосилоксаном (-Fe2O3@SiO2-NH2) использовали как носитель для проведения отбора ДНК–аптамеров к низкомолекулярному белку-онкомаркеру сурвивину (BIRC5, 16,5 кДа) из рандомизированной синтетической ДНК–библиотеки методом SELEX. Сурвивин ковалентно иммобилизовали на поверхность наночастиц. Мониторинг обогащения библиотек проводили с помощью твердофазного биолюминесцентного иммуноанализа и методом плавления ДНК. Показана перспективность применения полученных наночастиц для эффективного отбора аптамеров, специфичных к заданной мишени