PASS Prediction, ADMET and Molecular Docking Studies of Some Mannopyranoside Derivatives Against HCV NS 5B Polymerase

Abstract

Several carbohydrate-based medications are now being used to treat a variety of human ailments all around the world. Therefore, we concentrated on computational investigations of previously synthesized methyl α-D‑mannopyranoside (MDM) derivatives. To determine the structural and thermodynamical properties of the modified derivatives, a quantum chemical research was conducted using Gaussian09 employing density functional theory (DFT). Molecular electrostatic potential (MEP) calculation has performed to calculate their possible electrophilic and nucleophilic attack. The binding energy and binding strategies of certain viral proteins from the Hepatitis C virus (2IJN, 3MWV, and 3FKQ) were investigated using molecular docking simulations, and adequate binding affinity was discovered. ADMET calculations predict the improved pharmacokinetic properties with better drug-likeness profile of all MDM derivatives. Finally, these compounds can be described as molecules with high antiviral/antimicrobial potential that have been modified in terms of their structural side chains in α-D‑mannopyranoside sequence

Несколько препаратов на основе углеводов в настоящее время используются для лечения различных заболеваний человека по всему миру. Поэтому мы сосредоточились на вычислительных исследованиях ранее синтезированных производных метил-α-D‑маннопиранозида (MDM). Чтобы определить структурные и термодинамические свойства модифицированных производных, было проведено квантово-химическое исследование с применением Gaussian 09 и с использованием теории функционала плотности (DFT). Был проведен расчет молекулярного электростатического потенциала (MEP) для расчета их возможной электрофильной и нуклеофильной атаки. Энергия связывания и стратегии связывания определенных вирусных белков вируса гепатита С (2IJN, 3MWV и 3FKQ) были исследованы с использованием моделирования молекулярного докинга, и была обнаружена адекватная аффинность связывания. Расчеты ADMET предсказывают улучшенные фармакокинетические свойства с лучшим профилем лекарственного подобия всех производных MDM. Наконец, эти соединения могут быть описаны как молекулы с высоким противовирусным/антимикробным потенциалом, которые были модифицированы с точки зрения их структурных боковых цепей в последовательности α-D‑маннопиранозида