Моделирование белковых структур с помощью структурных деревьев
View/ Open:
URI (for links/citations):
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/937Author:
Ефимов, Александр В.
Efimov, Alexander V.
Date:
2008-09Abstract:
В работе представлены результаты исследований пространственной структуры белков,
полученные путем построения и анализа структурных деревьев белков. При построении
структурных деревьев в качестве стартовой или корневой структуры древа берется
соответствующий структурный мотив, который встречается во всех белках данного
семейства. Структуры более высокого порядка получаются путем последовательного
пристраивания других структурных элементов к растущей структуре в соответствии
с набором простых правил, выведенных из известных принципов структурной организации
белков. При этом моделируются все разрешенные пути роста корневой и промежуточных
структур, которые приводят в конечном счете к известным или пока неизвестным
белковым структурам. Построенные таким образом структурные деревья являются
удобным и перспективным инструментом для решения целого ряда задач. Среди них – поиск
всех разрешенных пространственных структур, как известных, так и пока неизвестных;
моделирование возможных путей сворачивания белков; изучение сходства и различия
пространственных структур белковых молекул; разработка структурной классификации
белков; изучение взаимосвязи между структурой и функцией белков. This review reports possibilities on the application of inorganics nanoparticles for cancer diagnoses
and treatment. The examples of the nanoparticles use as contrast agent for magnetic resonance
imaging, fluorescent biomarkers in a microscopy and fluorescent markers in the living tomography
of tumour growth are resulted. The prospects of the of the nanoparticles use (on fullerenes example)
are considered as fotosensibilizators, generating singlet oxygen. Also note that it may be possible
to use gold nanoparticles as heat-producing therapeutic agents for local tumour cells damage,
caused by laser warming-up of nanoparticles on a wave-length plazmon resonance. Information is
presented about nanoparticles use for drug delivery. At the same time, on own experimental material
accumulation nanoparticles in macrophages, litoral cells of the inguinal lymph node and hepatocytes
after their introduction in tumors growth area are investigated. The features of tumors metastasize to
sentinel lymph nodes and liver after nanoparticles injection are studied.
Collections:
Metadata:
Show full item recordRelated items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
DFT investigation of electronic structures and magnetic properties of halides family MeHal3 (Me=Ti, Mo,Zr,Nb, Ru, Hal=Cl,Br,I) one dimensional structures
Кузубов, Александр Александрович; Ковалева, Евгения Андреевна; Попова, Мария Игоревна; Холтобина, Анастасия Сергеевна; Михалева, Наталья Сергеевна; Высотин, Максим Александрович; Федоров, Александр Семенович (2017-10) -
One disorder out of two orders: Synthesis and crystal structures of cation-ordered PbNaF2NO3, anion-ordered Pb2OFNO3, and continuous disordered (Pb,Na)2(O,F)2-δNO3 solid solution with Sillén-derived structures
Dmitri O. Charkin; Igor V. Plokhikh; Aleksandr N. Zaloga; Maxim V. Lobanov; Sergey M. Kazakov (2017-09)Two new Sillen-like layered lead fluoride nitrates, PbNaF2NO3 and Pb2OFNO3, have been prepared at 300 C. PbNaF2NO3 is a structural analog of alkaline earth – bismuth oxyhalides, BaBiO2X and SrBiO2X (X = Cl – I), but not ... -
DFT investigation of electronic structures and magnetic properties of halides family MeHal(3) (Me=Ti, Mo,Zr,Nb, Ru, Hal=Cl,Br,I) one dimensional structures
Kuzubov, A. A.; Kovaleva, E. A.; Popova, M. I.; Kholtobina, A. S.; Mikhaleva, N. S.; Visotin, M. A.; Fedorov, A. S. (2017-10) -
Gallium Composition-Dependent Structural Phase Transitions in HoFe3–xGax(BO3)4 Solid Solutions: Crystal Growth, Structure, and Raman Spectroscopy Study
Evgeniya, Moshkina; Svetlana, Krylova; Irina, Gudim; Maxim, Molokeev; Vladislav, Temerov; Pavlovskiy, M. S.; Alexander, Vtyurin; Alexander, Krylov (2020-02)Single crystals of solid solutions of HoFe3–xGax(BO3)4 with x = 0, 0.5, 1, 1.5, and 3 were obtained using flux synthesis. The conditions of the synthesis are described in detail. The structural properties of each of the ... -
Study of the Structure of Asphaltenes and Coke Isolated from the Products of Cracking of a Mixture of Oil Residues and Sunflower oil by X-Ray Structural Analysis
Boyar, Stanislav V.; Kopytov, Mikhail A.; Бояр, С. В.; Копытов, М. А. (Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University, 2023-09)The aim of the work is to evaluate the effect of sunflower oil additives in oil residues on the structure of the formed asphaltenes and coke in the cracking process. Cracking of oil residues and their mixtures with sunflower ...