Разработка микросателлитных маркеров лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) на основе полногеномного de novo секвенирования

Abstract

Магистерская диссертация по теме «Разработка микросателлитных маркеров лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) на основе полногеномного de novo секвенирования» состоит из введения, 6 глав, вывододв, библиографического списка и приложений. Работа изложена на 63 страницах текстового документа, содержит 5 рисунков, 9 таблиц, 6 формул, 2 приложения, 77 использованных источников литературы. Цель исследования — разработка полиморфных ядерных микросателлитных (SSR) маркеров для лиственницы сибирской и их апробация. Задачи: 1. поиск тандемно повторяющихся последовательностей с заданными параметрами и дизайн праймеров для отобранных повторов; 2. проверка праймеров на однократную встречаемость в геноме; 3. отбор полиморфных маркеров и оценка уровня аллельного разнообразия; 4. тестирование отобранных маркеров на популяциях трех видов лиственницы. В работе был разработан набор из 14 SSR-локусов, подходящих для проведения популяционно-генетических исследований Larix sibirica Ledeb., L. gmelinii (Rupr.) Rupr. и L. cajanderi Mayr. Проведен первичный популяционно-генетический анализ выборок из популяций трех видов лиственницы, определены значения основных параметров генетического разнообразия, получены оценки подразделенности и степени дифференциации, показана эффективность разработанных маркеров.