Экспрессия генов у сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour.) и сосны обыкновенной (Pinus sylvestris Ledeb.) с аномальным морфогенезом кроны

Abstract

В настоящее время механизмы возникновения «ведьминых метел» непатогенного типа остаются невыясненными. Предположительно, такие участки кроны со слабовыраженным верхушечным доминированием и обильным ветвлением являются фенотипическим проявлением соматических мутаций в вегетативных почках растения. Ключевая задача работы – найти и охарактеризовать гены с различием в уровне экспрессии у «ведьминых метел» и участков нормальной кроны у двух хвойных видов: сосны сибирской кедровой и сосны обыкновенной. Был проведен поиск точечных мутаций в транскриптах «ведьминых метел» с использованием подхода для поиска однонуклеотидных полиморфизмов. Для пяти деревьев было секвенировано 20 образцов матричной РНК, собраны транскриптомы сосен. Для сосны сибирской кедровой найдено 10 генов с различиями в уровне экспрессии, для сосны обыкновенной – 7 генов. Также найдено 5 однонуклеотидных полиморфизмов, характерных для образцов «ведьминых метел».