Филогеография тополевой моли-пестрянки Phyllonorycter populifoliella (Lepidoptera: Gracillariidae) – массового вредителя тополей в Сибири
Скачать файл:
URI (для ссылок/цитирований):
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/151213Автор:
Кириченков, Наталья Ивановна
Научный руководитель:
Крутовский, Константин Валерьевич
Коллективный автор:
Институт фундаментальной биологии и биотехнологии
Кафедра геномики и биоинформатики
Дата:
2023Библиографическое описание:
Кириченков, Наталья Ивановна. Филогеография тополевой моли-пестрянки Phyllonorycter populifoliella (Lepidoptera: Gracillariidae) – массового вредителя тополей в Сибири [Электронный ресурс] : магистерская диссертация : 06.04.01 / Н. И. Кириченков. — Красноярск : СФУ, 2023.Специальность выпускной работы:
06.04.01 БиологияОбразовательная программа выпускной работы:
06.04.01.06 Геномика и биоинформатикаУчёная степень или квалификация, на которую выполнена работа:
МагистрТекст работы публикуется с изъятиями.
Аннотация:
Объектом исследования явились азиатские (сибирские) и европейские популяции Ph. populifoliella, а также образцы тополевых молей-пестрянок из исторических гербарных образцов, собранных в XIX–XX веках.
Цель работы: филогеографический анализ популяций тополевой моли-пестрянки Ph. populifoliella в Сибири и за ее пределами и поиск свидетельств расширения границ ареала вида.
В результате работы освоены: метод секвенирования по Сэнгеру; горизонтальный гель-электрофорез в агарозном геле; идентификация видов насекомых и поиск ближайших соседей на платформе генетических баз данных BOLD (Barcode of Life Data System, https://boldsystems.org/) и GenBank (NCBI); разработка генетических библиотек на платформе BOLD и депонирование сиквенсов в BOLD и GenBank; выравнивание нуклеотидных последовательностей в программе BioEdit, CodonCode; филогенетический анализ и филогеографический анализы с использованием биоинформатических инструментов на генетической платфоме BOLD; программы для анализа молекулярно-генетических данных MEGA, FigTree, PopArt, DnaSP, Arlequin.
В результате исследований разработана обновляемая молекулярно-генетическая библиотека тополевой моли-пестрянки на базе генетической платформы BOLD (Barcode Of Life Data system) и произведено ее наполнение сиквенсами гена COI мтДНК, оригинальными электроферограммами, биогеографическими данными и фотографиями изученных образцов. Оценен диапазон внутривидовой генетической вариабельности вида на основе анализа 101 образцов из современного ареала вида в Палеарктике с акцентом на Сибирь. Исследована филогеография вида с установлением 29 гаплотипов по гену COI мтДНК и оценена их встречаемость в Азии (преимущественно в Сибири) и странах Восточной и Западной Европы. Выявлен уникальный гаплотип тополевой моли-пестрянки в недавно задокументированной популяции вида на севере Индии и рассмотрен вопрос о возможном инвазионном происхождении Ph. populifoliella в Индии. С применением секвенирования нового поколения (платформа Sequel, PacBio) по останкам гусениц и куколок, обнаруженным в минах на листьях 173-летних гербарных образцов тополей из Европы, США и Канады, идентифицировано четыре вида тополевых молей-пестрянок (три палеарктических и один неарктический) и показано, что заносов палеарктического вида Ph. populifoliella в Северную Америку по исследованным историческим материалам 1850–1974 гг. не происходило.
Коллекции:
- Магистерские диссертации [4085]