Comprehensive Insights into Composition, Metabolic Potentials, and Interactions among Archaeal, Bacterial, and Viral Assemblages in Meromictic Lake Shunet in Siberia
Скачать файл:
URI (для ссылок/цитирований):
http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2018.01763/full?&utm_source=Email_to_authors_&utm_medium=Email&utm_content=T1_11.5e1_author&utm_campaign=Email_publication&field=&journalName=Frontiers_in_Microbiology&id=366441https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/111205
Автор:
Wu, Yu-Ting
Yang, Yu-Cheng
Chiang, Pei-Wen
Tseng, Ching-Hung
Chiu, Hsiu-Hui
Saeed, Isaam
Baatar, Bayanmunkh
Рогозин, Денис
Halgamuge, Saman
Degermendzhi, Andrei
Tang, Sen-Lin
Коллективный автор:
Институт фундаментальной биологии и биотехнологии
Кафедра биофизики
Дата:
2018-08Журнал:
Frontiers in MicrobiologyКвартиль журнала в Scopus:
Q1Квартиль журнала в Web of Science:
Q1Библиографическое описание:
Wu, Yu-Ting. Comprehensive Insights into Composition, Metabolic Potentials, and Interactions among Archaeal, Bacterial, and Viral Assemblages in Meromictic Lake Shunet in Siberia [Текст] / Yu-Ting Wu, Yu-Cheng Yang, Pei-Wen Chiang, Ching-Hung Tseng, Hsiu-Hui Chiu, Isaam Saeed, Bayanmunkh Baatar, Денис Рогозин, Saman Halgamuge, Andrei Degermendzhi, Sen-Lin Tang // Frontiers in Microbiology: Aquatic Microbiology. — 2018. — Т. 9 (№ 1763). — С. 1763Аннотация:
Microorganisms are critical to maintaining stratified biogeochemical characteristics
in meromictic lakes; however, their community composition and potential roles in
nutrient cycling are not thoroughly described. Both metagenomics and metaviromics
were used to determine the composition and capacity of archaea, bacteria, and
viruses along the water column in the landlocked meromictic Lake Shunet in Siberia.
Deep sequencing of 265 Gb and high-quality assembly revealed a near-complete
genome corresponding to Nonlabens sp. sh3vir. in a viral sample and 38 bacterial
bins (0.2–5.3Mb each). The mixolimnion (3.0m) had the most diverse archaeal,
bacterial, and viral communities, followed by the monimolimnion (5.5m) and chemocline
(5.0m). The bacterial and archaeal communities were dominated by Thiocapsa and
Methanococcoides, respectively, whereas the viral community was dominated by
Siphoviridae. The archaeal and bacterial assemblages and the associated energy
metabolism were significantly related to the various depths, in accordance with the
stratification of physicochemical parameters. Reconstructed elemental nutrient cycles
of the three layers were interconnected, including co-occurrence of denitrification
and nitrogen fixation in each layer and involved unique processes due to specific
biogeochemical properties at the respective depths. According to the gene annotation,
several pre-dominant yet unknown and uncultured bacteria also play potentially important
roles in nutrient cycling. Reciprocal BLAST analysis revealed that the viruses were specific
to the host archaea and bacteria in the mixolimnion. This study provides insights into
the bacterial, archaeal, and viral assemblages and the corresponding capacity potentials
in Lake Shunet, one of the three meromictic lakes in central Asia. Lake Shunet was
determined to harbor specific and diverse viral, bacterial, and archaeal communities
that intimately interacted, revealing patterns shaped by indigenous physicochemical
parameters.
Коллекции:
Метаданные:
Показать полную информациюСвязанные материалы
Показаны похожие ресурсы по названию, автору или тематике.
-
Анализ результатов мониторинга биологических сообществ в некоторых озерах
Алимов, А.Ф.; Alimov, Alexander F. (Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University, 2017-12)Выполнен анализ динамики первичной продукции планктона, биомассы сообществ зоопланктона и бентоса в оз. Красное (Ленинградская обл.) в период 1964–1984 гг., в Нарочанских озерах (Беларусь) с 1978 по 2010 г., а также в ... -
Основные результаты многолетних исследований макрозообентоса озер Нарочь, Мястро, Баторино (Беларусь)
Макаревич, О.А.; Makarevich, Oleg A. (Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University, 2018)В статье проанализированы тенденции изменения таксономической структуры, плотности, биомассы комплекса макрозообентоса и его доминирующих групп в оз. Нарочь, Мястро, Баторино за период исследований с 1947 по 2015 гг., ... -
Олигохеты некоторых пресных водоемов Арктики
Батурина, М.А.; Baturina, Maria A.; Лоскутова, О.А.; Loskutova, Olga A. (Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University., 2010-06)Определен видовой состав малощетинковых червей (Oligochaeta: Annelida) из пятнадцати озер Полярного Урала и восточной части Большеземельской тундры. Приведено число видов, количественные показатели развития олигохет с ... -
Characteristics of Fatty Acid Composition of Gammarus lacustris Inhabiting Lakes with and without Fish
Makhutova, O. N.; Sharapova, T. A.; Kalachova, G. S.; Shulepina, S. P.; Gladysheva, M. I. (2016)—The effect of a biotic factor—the presence of predatory fish in water—on the composition and content of fatty acids in crustaceans was studied in the populations of the lake amphipod Gammarus lacustris from two lakes with ... -
Таксономический состав зоопланктона солоноватых озер Турано-Уюкской котловины (Республика Тыва)
Кирова, Н. А.; Ойдуп, Ч. К.; Kirova, Nadezhda A.; Oydup, Choigana K. (Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University, 2022-03)Исследован таксономический состав зоопланктона солоноватых озер Белое, Аржаан, Кислое и двух водоемов, расположенных в Турано-Уюкской котловине (Республика Тыва). Озеро Белое имеет статус памятника природы регионального ...