Author | Kirillova, Maria A. | en |
Author | Esimbekova, Elena N. | en |
Author | Ranjan, Rajeev | en |
Author | Torgashina, Irina G. | en |
Author | Kratasyuk, Valentina A. | en |
Author | Кириллова, М.А. | ru_RU |
Author | Есимбекова, Е.Н. | ru_RU |
Author | Ранджан, Р | ru_RU |
Author | Торгашина, И.Г. | ru_RU |
Author | Кратасюк, В.А. | ru_RU |
Accessioned Date | 2018-07-06T05:18:55Z | |
Available Date | 2018-07-06T05:18:55Z | |
Issued Date | 2018-06 | |
URI (for links/citations) | https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/71720 | |
Abstract | Microbial contamination is usually analyzed using luciferin-luciferase system of fireflies by the detection
of adenosine-5’-triphosphate (ATP). There is an opportunity to assess the bacterial contamination
of various objects based on a quantitative analysis of other nucleotides. In the present study, a
bioluminescent enzyme system of luminous bacteria NADH:FMN-oxidoreductase (Red) and luciferase
(BLuc) was investigated to understand if it can be used for quantitative measurements of bacterial
cells by nicotinamide adenine dinucleotide (NADH) and flavin mononucleotide (FMN) detection. To
increase the sensitivity of bioluminescent system to FMN and NADH, optimization of assay conditions
was performed by varying enzymes and substrates concentrations. The lowest limits of detection were
1.2 nM FMN and 0.1 pM NADH. Escherichia coli cells were used as a model bacterial sample. FMN
and NADH extraction was made by destructing cell membrane by ultrasonication. Cell suspension
was added into the reaction mixture instead of FMN and NADH, and light intensity depended on
number of bacterial cells in the reaction mixture. Centrifugation of sonicated sample as an additional
step of sample preparation did not improve the sensitivity of method. The experimental results showed
that Red and BLuc system could detect at least 800 thousand bacterial cells mL-1 by determining
concentration of NADH extracted from lysed cells, while 3.9 million cells mL-1 can be detected by
determining concentration of FMN | en |
Abstract | Для анализа микробного загрязнения широко используется биолюминесцентный метод,
основанный на определении аденозин-5’-трифосфата (АТР) с помощью люциферин-
люциферазной системы светляков. Существует принципиальная возможность оценки степени
бактериальной обсемененности различных объектов исходя из количественного анализа
других нуклеотидов. В работе исследована возможность применения биолюминесцентной
системы светящихся бактерий NADH:FMN-оксидоредуктаза (Red) и люцифераза (BLuc)
для количественного анализа бактериальных клеток путем определения количества
никотинамидадениндинуклеотида (NADH) и флавинмононуклеотида (FMN) в образце. Для
увеличения чувствительности биолюминесцентной системы к FMN и NADH осуществлена
оптимизация условий проведения анализа путем подбора концентраций ферментов и
субстратов в реакционной смеси. Максимальная чувствительность биферментной системы
Red + BLuc составила 1,2 нМ FMN и 0,1 пМ NADH. Для проведения количественного анализа
бактериальных клеток использовали модельный бактериальный образец – культуру Escherichia
coli. Экстрагирование FMN и NADH проводили путем разрушения клеточной мембраны
ультразвуковым дезинтегратором. Клеточную суспензию добавляли в реакционную смесь
вместо раствора FMN или NADH, при этом интенсивность свечения биолюминесцентной
системы зависела от количества бактериальных клеток в реакционной смеси. Введение в
пробоподготовку дополнительной процедуры центрифугирования образца, подвергнутого
ультразвуковой обработке, не привело к увеличению чувствительности метода. Таким образом,
было показано, что чувствительности биферментной системы Red + BLuc достаточно для
определения не менее 800 тыс бактериальных клеток в миллилитре путем экстрагирования
NADH из разрушенных клеток. При анализе, основанном на определении концентрации FMN в
бактериальном образце, чувствительность метода составила 3,9 млн клеток на миллилитр | ru_RU |
Language | en | en |
Publisher | Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University | en |
Subject | NADH:FMN-oxidoreductase | en |
Subject | bacterial luciferase | en |
Subject | bacterial contamination | en |
Subject | Escherichia coli | en |
Subject | NADH:FMN-оксидоредуктаза | en |
Subject | бактериальная люцифераза | ru_RU |
Subject | бактериальное загрязнение | ru_RU |
Subject | Escherichia coli | ru_RU |
Title | Bioluminescent System of Luminous Bacteria for Detection of Microbial Contamination | en |
Alternative Title | Биолюминесцентная система светящихся бактерий для анализа микробного загрязнения | ru_RU |
Type | Journal Article | en |
Contacts | Kirillova, Maria A.: Siberian Federal University 79 Svobodny, Krasnoyarsk, 660041, Russia | en |
Contacts | Esimbekova, Elena N.: Siberian Federal University 79 Svobodny, Krasnoyarsk, 660041, Russia; Institute of Biophysics SB RAS FRC “Krasnoyarsk Science Center SB RAS” 50/50 Akademgorodok, Krasnoyarsk, 660036, Russia; esimbekova@yandex.ru | en |
Contacts | Ranjan, Rajeev: Siberian Federal University 79 Svobodny, Krasnoyarsk, 660041, Russia | en |
Contacts | Torgashina, Irina G.: Siberian Federal University 79 Svobodny, Krasnoyarsk, 660041, Russia | en |
Contacts | Kratasyuk, Valentina A.: Siberian Federal University 79 Svobodny, Krasnoyarsk, 660041, Russia; Institute of Biophysics SB RAS FRC “Krasnoyarsk Science Center SB RAS” 50/50 Akademgorodok, Krasnoyarsk, 660036, Russia | en |
Contacts | Кириллова, М.А.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79 | ru_RU |
Contacts | Есимбекова, Е.Н.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79; Институт биофизики СО РАН ФИЦ «Красноярский научный центр СО РАН» Россия, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/50 | ru_RU |
Contacts | Ранджан, Р: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79 | ru_RU |
Contacts | Торгашина, И.Г.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79 | ru_RU |
Contacts | Кратасюк, В.А.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, пр. Свободный, 79; Институт биофизики СО РАН ФИЦ «Красноярский научный центр СО РАН» Россия, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/50 | ru_RU |
Pages | 174-180 | ru_RU |
Journal Name | Журнал Сибирского федерального университета. Биология. Journal of Siberian Federal University. Biology; 2018 11 (2) | en |