Показать сокращенную информацию
Микроэволюционные отношения между сибирскими видами Elymus margaritae, E. komarovii и E. transbaicalensis (Poaceae) по данным секвенирования ядерного гена GBSS 1 (waxy) и гибридизации
Автор | Агафонов, А. В. | ru_RU |
Автор | Шабанова (Кобозева), Е. В. | ru_RU |
Автор | Асбаганов, С. В. | ru_RU |
Автор | Agafonov, Alexander V. | en |
Автор | Shabanova (Kobozeva), Elena V. | en |
Автор | Asbaganov, Sergey V. | en |
Дата внесения | 2024-09-20T06:53:38Z | |
Дата, когда ресурс стал доступен | 2024-09-20T06:53:38Z | |
Дата публикации | 2024-09 | |
URI (для ссылок/цитирований) | https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/153845 | |
Аннотация | Проведено сравнительное изучение последовательности фрагмента малокопийного ядерного гена waxy (гранул-связанная синтаза крахмала 1, GBSS 1) у образцов близкородственных видов Elymus margaritae, E. komarovii и E. transbaicalensis из Горного Алтая и Восточного Саяна. Проведена оценка микроэволюционных взаимоотношений между видами путем построения ML дендрограмм на основе фрагментов гена (с 9 по 14 экзон) в двух вариантах: а) отдельно по экзонам с интронами; б) только по интронам между 9 и 14 экзонами. Показано, что варианты субгеномов St у образца E. margaritae AUK-0650, образца E. komarovii GAR-0501, а также трех образцов E. transbaicalensis расположены в общей ветви (кладе) и относятся к азиатской предковой линии St1 Pseudoroegneria strigosa вместе с субгеномами видов E. gmelinii и E. pendulinus. Единственный идентифицированный вариант субгенома St у E. margaritae GUK-1709 расположен в кладе, объединяющем группу видов с субгеномами St2, близких к североамериканской линии Pseudoroegneria spicata. По дифференциации субгенома Н изучаемые виды заметных различий не проявили. Динамика значений семенной фертильности (СФ) в поколениях F1–F2 показала следующие результаты: а) СФ гибридов между биотипами E. margaritae GUK-1709 и AUK-0650 соответствовала внутривидовым отношениям на уровне α1, несмотря на отдаленность между клонами GBSS 1; б) значения СФ в варианте скрещивания E. margaritae GUK-1709 × E. komarovii GAR-0501 соответствуют половой совместимости на α2-уровне; в) репродуктивная совместимость между E. margaritae GUK-1709 и двумя биотипами E. transbaicalensis показала разные результаты. В комбинации GUK-1709 × AUL-1742 гибриды оказались полностью стерильными, в то время как в комбинации GUK-1709 × AUR-1713 получены результаты, соответствующие внутривидовым отношениям. Обсуждаются основания для отнесения биотипа AUR-1713 к короткоостому морфотипу вида Elymus margaritae | ru_RU |
Аннотация | A comparative study of the sequence of the low-copy nuclear gene waxy (granule-bound starch synthase 1, GBSS 1) fragments was carried out in samples of closely related species Elymus margaritae, E. komarovii, and E. transbaicalensis from the Altai Mountains and the Eastern Sayan Mountains. An assessment of microevolutionary relationships between the species was carried out by constructing ML dendrograms based on gene fragments in two versions: a) separately for exons with introns from exons 9 to 14; b) only in introns between exons 9 and 14. The study showed that the variants of the St subgenomes in the E. margaritae AUK-0650 accession, the E. komarovii GAR-0501 accession, and three E. transbaicalensis accessions are located in a common branch (clade) and belong to the Asian ancestral line St1 of the genus Pseudoroegneria along with the subgenomes in the E. gmelinii and E. pendulinus species. The only identified variant of the St subgenome in E. margaritae GUK-1709 is located in a clade that includes a group of species with St2 subgenomes close to the North American lineage of Ps. spicata. The species studied in this research did not show any noticeable differences in differentiation of the H subgenome. The dynamics of seed fertility (SF) values in generations F1–F2 was as follows: a) SF of hybrids of E. margaritae GUK-1709 and AUK-0650 biotypes corresponded to intraspecific relationships at the α1 level, despite the distance between their GBSS 1 clones; b) SF values in the E. margaritae GUK-1709 × E. komarovii GAR-0501 cross variant corresponded to sexual compatibility at the α2 level; c) reproductive compatibility between E. margaritae GUK-1709 and two biotypes of E. transbaicalensis showed different results. In the GUK-1709 × AUL-1742 combination, the hybrids turned out to be completely sterile, while in the GUK-1709 × AUR-1713 combination, the results were consistent with intraspecific relationships. The basis for classifying biotype AUR-1713 as a short-awned morphotype of the species Elymus margaritae is discussed | en |
Язык | ru | ru_RU |
Издатель | Journal of Siberian Federal University. Сибирский федеральный университет | en |
Тема | видообразование | ru_RU |
Тема | гибридизация | ru_RU |
Тема | наследование | ru_RU |
Тема | таксономия | ru_RU |
Тема | Elymus | ru_RU |
Тема | Poaceae | ru_RU |
Тема | speciation | en |
Тема | hybridization | en |
Тема | inheritance | en |
Тема | taxonomy | en |
Тема | Elymus | en |
Тема | Poaceae | en |
Название | Микроэволюционные отношения между сибирскими видами Elymus margaritae, E. komarovii и E. transbaicalensis (Poaceae) по данным секвенирования ядерного гена GBSS 1 (waxy) и гибридизации | ru_RU |
Альтернативное название | Microevolutionary Relationships Between the Siberian Species Elymus margaritae, E. komarovii, and E. transbaicalensis (Poaceae) Based on Sequencing of the Nuclear Gene GBSS 1 (waxy) and Hybridization | en |
Тип | Journal Article | ru_RU |
Контакты автора | Агафонов, А. В.: Центральный сибирский ботанический сад СО РАН Российская Федерация, Новосибирск | ru_RU |
Контакты автора | Шабанова (Кобозева), Е. В. : Центральный сибирский ботанический сад СО РАН Российская Федерация, Новосибирск | ru_RU |
Контакты автора | Асбаганов, С. В. : Центральный сибирский ботанический сад СО РАН Российская Федерация, Новосибирск | ru_RU |
Контакты автора | Agafonov, Alexander V. : Central Siberian Botanical Garden SB RAS Novosibirsk, Russian Federation; agalex@mail.ru ORCID: 0000-0002-1403-5867 | en |
Контакты автора | Shabanova (Kobozeva), Elena V. : Central Siberian Botanical Garden SB RAS Novosibirsk, Russian Federation; ORCID: 0000-0002-6566-9325 | en |
Контакты автора | Asbaganov, Sergey V. : Central Siberian Botanical Garden SB RAS Novosibirsk, Russian Federation; ORCID: 0000-0002-7482-7495 | en |
Страницы | 248–263 | ru_RU |
Журнал | Журнал сибирского федерального университета. 2024 17(3). Journal of Siberian Federal University. Biology 2024 17(3) | en |
EDN | XCDCZL |