Show simple item record

Буслаев, В. Ю.ru_RU
Мацкова, Л. В.ru_RU
Минина, В. И.ru_RU
Дружинин, В. Г.ru_RU
Buslaev, Vladislav Yu.en
Matskova, Lyudmila V.en
Minina, Varvara I.en
Druzhinin, Vladimir G.en
2022-10-17T08:18:57Z
2022-10-17T08:18:57Z
2022-09
https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/149185
Микробиота легочной системы способна оказывать значимое влияние на стабильность структуры и функциональную активность легких. Инициация и прогрессирование некоторых заболеваний легких зависит от патогенных факторов, экспрессируемых легочной микробиотой, и состояния дисбиоза в целом. Метагеномные исследования, основанные на секвенировании генов 16S рРНК, позволили получить актуальные данные о составе легочной микробиоты. Гены 16S рРНК состоят из 9 вариабельных участков (V1- V9). Определение более консервативных в эволюционном плане участков последовательностей 16S рРНК гена позволяет относить исследуемые геномы бактерий к таксонам более высокого порядка, в то время как получение информации о менее консервативных участках позволяет определять принадлежность бактерий к роду или виду. В настоящее время также активно развивается метатранскриптомика, основанная на оценке числа копий транскриптов легочной микробиоты. Существование разнообразия и избыточности генов, а также вариабельность их активности в разных условиях предполагает использование таких высокопроизводительных технологий, как секвенирование РНК и методы параллельного секвенирования. Полученные данные по метатранскриптомному анализу в значительной степени дополняют результаты метагеномных исследований, в то же время предполагается, что метатранскриптомный подход более информативен, что касается исследований функциональных взаимодействий между микробиотой и организмом-хозяином. Эти подходы предполагают оценку биологической активности различных компонентов микробиома в норме и патологии. В обзоре рассмотрены методические особенности применения метагеномного анализа, а также метатранскриптомных исследований при некоторых тяжелых заболеваниях легочной системы (рак легкого, хроническая обструктивная болезнь легких, астма и муковисцидоз)ru_RU
The structural stability of the respiratory system and the functional activity of the lungs are influenced by the local microflora. The initiation and the progression of some lung diseases are determined by pathogenic factors produced by the lung microbiota and the dysbiotic conditions in general. Metagenomic studies based on sequencing of the genes for 16S ribosomal RNA have been used to collect direct data on the composition of the lung microbiota. 16S rRNA genes consist of 9 variable regions (V1-V9). By determining highly conservative 16S rRNA regions, bacterial genomes can be assigned to higher-level taxa, while based on information about less conservative regions of these genes, the genera or species of bacteria can be identified. Metatranscriptomics, which is based on estimating the number of copies of transcripts from the pulmonary microbiota, is also rapidly developing. The diversity and redundancy of genes and their variable activity in different conditions are prerequisites for using high-performance technologies such as RNA‑seq and parallel sequencing methods. The metatranscriptomic analysis data significantly complement metagenomics; at the same time, metatranscriptomics is assumed to be more informative in examination of functional interactions between microbiome and host organism. These approaches offer an estimation of the biological activity of different components in the microbiome under normal and pathological conditions. This review summarizes the results of recent metagenomic and metatranscriptomic studies regarding a number of serious diseases of the respiratory system (lung cancer, chronic obstructive lung disease, asthma, and cystic fibrosis)en
ruru_RU
Сибирский федеральный университет. Siberian Federal Universityen
метагеномикаru_RU
секвенирование 16S рРНКru_RU
метатранскриптомикаru_RU
РНК‑секвенированиеru_RU
хроническая обструктивная болезнь лёгкихru_RU
рак лёгкогоru_RU
муковисцидозru_RU
астмаru_RU
metagenomicsen
16S rRNA sequencingen
metatranscriptomicsen
RNA‑seqen
COPDen
lung canceren
cystic fibrosisen
asthmaen
Анализ микробиоты лёгких и респираторного тракта человека при заболеваниях легочной системы (обзор)ru_RU
Analysis of the Microbiome of Human Lungs and Respiratory System in Lung Disorders: a Reviewen
Journal Articleru_RU
Буслаев, В. Ю.: Федеральный исследовательский центр угля и углехимии СО РАН Институт экологии человека Российская Федерация, Кемеровоru_RU
Мацкова, Л. В.: Балтийский федеральный университет имени Канта Российская Федерация, Калининградru_RU
Минина, В. И.: Федеральный исследовательский центр угля и углехимии СО РАН Институт экологии человека Российская Федерация, Кемерово; Кемеровский государственный университет Российская Федерация, Кемеровоru_RU
Дружинин, В. Г.: Кемеровский государственный университет Российская Федерация, Кемеровоru_RU
Buslaev, Vladislav Yu.: Federal Research Centre of Coal and Coal Chemistry SB RAS Institute of Human Ecology Kemerovo, Russian Federation; vladislasbus2358@yandex.ru; ORCID: 0000-0001-5566-5323en
Matskova, Lyudmila V.: Immanuel Kant Baltic Federal University Kaliningrad, Russian Federation; ORCID: 0000-0002-3174-1560en
Minina, Varvara I.: Federal Research Centre of Coal and Coal Chemistry SB RAS Institute of Human Ecology Kemerovo, Russian Federation; Kemerovo State University Kemerovo, Russian Federation; ORCID: 0000-0003-3485-9123en
Druzhinin, Vladimir G.: Kemerovo State University Kemerovo, Russian Federation; 0000-0002-5534-2062en
396–421ru_RU
10.17516/1997-1389-0395
Журнал Сибирского федерального университета.Биология. Journal of Siberian Federal University.Biology, 2022 15 (3)en


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV