Lost Strings in Genomes: What Sense Do They Make?
Скачать файл:
URI (для ссылок/цитирований):
http://www.springer.com/series/5381https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/70093
Автор:
Садовский, Михаил Георгиевич
Jean-Fred, Fontaine
Miguel A. Andrade-Navarro
Якубайлик, Юрий Олегович
Руденко, Наталья Владимировна
Коллективный автор:
Институт фундаментальной биологии и биотехнологии
Базовая кафедра защиты и современных технологии мониторинга лесов
Дата:
2017-04Журнал:
Lecture Notes in Computer ScienceКвартиль журнала в Scopus:
Q2Библиографическое описание:
Садовский, Михаил Георгиевич. Lost Strings in Genomes: What Sense Do They Make? [Текст] / Михаил Георгиевич Садовский, Fontaine Jean-Fred, Miguel A. Andrade-Navarro, Юрий Олегович Якубайлик, Наталья Владимировна Руденко // Lecture Notes in Computer Science: Lectures Notes in Bioinformatics. — 2017. — Т. 10209. — С. 20-29Аннотация:
We studied the sets of avoided strings to be observed over a family of genomes. It was found that the length of the minimal avoided string rarely exceeds 9 nucleotides, with neither respect to a phylogeny of a genome under consideration. The lists of the avoided strings observed over the sets of (related) genomes have been analyzed.Very low correlation between the phylogeny, and the set of those strings has been found.