Показать сокращенную информацию
Reads in NGS Are Distributed over a Sequence Very Inhomogeneously
Автор | Садовский, Михаил Георгиевич | |
Автор | Кобец, Виктория Алексеевна | |
Автор | Ходос, Георгий Александрович | |
Автор | Кузьмин, Дмитрий Александрович | |
Автор | Шаров, Вадим Витальевич | |
Дата внесения | 2020-01-20T07:56:17Z | |
Дата, когда ресурс стал доступен | 2020-01-20T07:56:17Z | |
Дата публикации | 2019-05 | |
Библиографическое описание | Садовский, Михаил Георгиевич. Reads in NGS Are Distributed over a Sequence Very Inhomogeneously [Текст] / Михаил Георгиевич Садовский, Виктория Алексеевна Кобец, Георгий Александрович Ходос, Дмитрий Александрович Кузьмин, Вадим Витальевич Шаров // Lectures Notes in Bioinformatics. — 2019. — Т. 11465. — С. 271-282 | |
URI (для ссылок/цитирований) | https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-030-17938-0_25 | |
URI (для ссылок/цитирований) | https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/129231 | |
Аннотация | Distribution of read starts over a sequences genetic entity is studied. Key question was whether the starts are distributed uniformly and homogeneously along a sequence, or there exist some spots of the increased local density of the starts. To answer the question, 15 bacterial genomes have been studied. It was found that some genomes exhibit extremely far distribution pattern, from an homogeneity, while others show lower level of the inhomogeneity. The inhomogeneity level was determined through the Kullback-Leibler distance between the real string distribution, and that one bearing the most probable continuations of the shorter strings. | |
Тема | Order | |
Тема | Digitalization | |
Тема | Entropy | |
Тема | Mutual entropy | |
Тема | Equilibrium | |
Название | Reads in NGS Are Distributed over a Sequence Very Inhomogeneously | |
Тип | Journal Article | |
Тип | Journal Article Preprint | |
Страницы | 271-282 | |
ГРНТИ | 34.03.23 | |
Дата обновления | 2020-01-20T07:56:17Z | |
DOI | 10.1007/978-3-030-17938-0_25 | |
Институт | Институт фундаментальной биологии и биотехнологии | |
Подразделение | Базовая кафедра защиты и современных технологии мониторинга лесов | |
Журнал | Lectures Notes in Bioinformatics | |
Квартиль журнала в Scopus | Q2 |