Показать сокращенную информацию
Phylogenetic Relationships, Pathogenic Traits, and Wood-Destroying Properties of Porodaedalea niemelaei M. Fischer Isolated in the Northern Forest Limit of Larix gmelinii Open Woodlands in the Permafrost Area
Автор | Pavlov, Igor N. | en |
Автор | Litovka, Yuliya A. | en |
Автор | Ryazanova, Tatyana V. | en |
Автор | Chuprova, Nelli A. | en |
Автор | Litvinova, Ekaterina A. | en |
Автор | Putintseva, Yuliya A. | en |
Автор | Kües, Ursula | en |
Автор | Krutovsky, Konstantin V. | en |
Автор | Павлов, И.Н. | ru_RU |
Автор | Литовка, Ю.А. | ru_RU |
Автор | Рязанова, Т.В. | ru_RU |
Автор | Чупрова, Н.А. | ru_RU |
Автор | Литвинова, Е.А. | ru_RU |
Автор | Путинцева, Ю.А. | ru_RU |
Автор | Кюс, У. | ru_RU |
Автор | Крутовский, К.В. | ru_RU |
Дата внесения | 2018-02-08T04:14:47Z | |
Дата, когда ресурс стал доступен | 2018-02-08T04:14:47Z | |
Дата публикации | 2018 | |
URI (для ссылок/цитирований) | https://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/70290 | |
Аннотация | The phytopathogenic and wood destroying traits were studied in a basidiomycete fungus, Porodaedalea niemelaei M. Fischer, widespread in Siberian permafrost woodlands of Gmelinii larch, Larix gmelinii (Rupr.) Rupr. Numerous stands of dying out and fallen larch trees with white-rot („corrosion rot“) were found in the study area. Butt rot incidence varied from 63 to 100 % depending on the stand age and raised up to 0.5-1.5 m above root collar on average or up to 9 m maximum. Root rot was also widespread, including larch undergrowth. The biodiversity of xylotrophic fungi was low, with a pronounced dominance of P. niemelaei. The main factors of dying out of L. gmelinii were infection by P. niemelaei promoted by mechanical damage of roots by reindeers during migration and climate anomalies. The cultures isolated from the fruiting bodies were identified as Porodaedalea niemelaei M. Fischer based on the combination of morphological, culture, and molecular genetic methods. Under laboratory conditions, the strains were characterized as psychrotolerant (temperature limit from 6 to 22 °C) and preferred cultural media based mostly on natural and plant substrates. The most active biodegradation occurred on the broadleaf wood substrates causing up to 50 % of the biomass loss accompanied by active decomposing of the lignocellulosic complex and increasing the amount of water-soluble substances. The phylogenetic analysis demonstrated that P. niemelaei is clearly different from other well-studied Porodaedalea species, such as P. chrysoloma, P. pini, and P. cancriformans, and is very close to a group of unclassified fungi isolated in Norway and Finland. The phylogenetic analysis included 43 isolates and was based on four genetic markers – ITS, nLSU, rpb2, and tef1, commonly used in fungal phylogenetics | en |
Аннотация | Изучены фитопатогенные и дереворазрушающие свойства базидиального гриба Porodaedalea niemelaei M. Fischer, широко распространённого на территории Сибири в районе вечной мерзлоты в редколесьях Larix gmelinii (Rupr.) Rupr. В районе исследования обнаружены многочисленные куртины усыхающих деревьев и ветровальные лиственницы с наличием коррозионной гнили. Встречаемость напенной гнили варьирует в пределах 63-100 % в зависимости от возраста древостоя; средняя высота подъема 0,5-1,5 м, максимально до 9 м. Корневая гниль распространена повсеместно, включая подрост лиственницы. Биоразнообразие ксилотрофных грибов скудное с выраженным доминированием P. niemelaei. Основным фактором усыхания Larix gmelinii является наличие грибной инфекции, способствующими – механическое повреждение корней и климатические аномалии. Культура гриба, изолированная из плодового тела, по совокупности морфолого-культуральных и молекулярно-генетических методов идентифицирована как Porodaedalea niemelaei M. Fischer. В лабораторных условиях штамм характеризуется как психротолерантный (температурный предел 6-22 °С), предпочитающий питательные среды на основе натуральных растительных компонентов. Биодеструкция растительных субстратов активнее протекает на лиственной древесине – убыль массы до 50 % на фоне активной биодеградации компонентов лигноцеллюлозного комплекса и увеличения количества водорастворимых веществ. Филогенетический анализ выявил значительные отличия P. niemelaei от других хорошо изученных видов Porodaedalea, таких как P. chrysoloma, P. pini и P. cancriformans, и близость к группе неклассифицированных грибов, выделенных в Норвегии и Финляндии. Филогенетический анализ включал 43 изолята и базировался на четырех маркерах (ITS, nLSU, rpb2 и tef1), широко применяемых в филогении грибов. Нуклеотидные последовательности всех маркеров были проверены в недавно полностью секвенированном геноме P. niemelaei, у изолята, использованного в этом исследовании (http://genome.jgi.doe.gov/PornieStandDraft_FD/PornieStandDraft_FD.info.html). | ru_RU |
Язык | en | en |
Издатель | Сибирский федеральный университет. Siberian Federal University | en |
Тема | butt and stem rot | en |
Тема | genome sequence | en |
Тема | ITS | en |
Тема | lignocellulosic complex | en |
Тема | molecular genetic markers | en |
Тема | nLSU | en |
Тема | phylogenetics | en |
Тема | Porodaedalea niemelaei | en |
Тема | rpb2 | en |
Тема | tef1 | en |
Тема | wood destroying psychrophilic phytopathogenic fungi | en |
Тема | white-rot | en |
Тема | wood biodegradation | en |
Тема | белая гниль | ru_RU |
Тема | биодеструкция древесины | ru_RU |
Тема | дереворазрушающие психрофильные фитопатогенные грибы | ru_RU |
Тема | лигноцеллюлозный комплекс | ru_RU |
Тема | молекулярно-генетические маркеры | ru_RU |
Тема | корневая и стволовая гниль | ru_RU |
Тема | ITS | ru_RU |
Тема | nLSU | ru_RU |
Тема | Porodaedalea niemelaei | ru_RU |
Тема | rpb2 | ru_RU |
Тема | tef1 | ru_RU |
Название | Phylogenetic Relationships, Pathogenic Traits, and Wood-Destroying Properties of Porodaedalea niemelaei M. Fischer Isolated in the Northern Forest Limit of Larix gmelinii Open Woodlands in the Permafrost Area | en |
Альтернативное название | Патогенные и дереворазрушающие свойства Porodaedalea niemelaei M. Fischer в редколесьях Larix gmelinii в районах вечной мерзлоты | ru_RU |
Тип | Journal Article | en |
Контакты автора | Pavlov, Igor N.: V.N. Sukachev Institute of Forest FRC «Krasnoyarsk Sceince Center of the SB RAS» 50/28 Akademgorodok, Krasnoyarsk, 660036, Russi;bSiberian Federal University 79 Svobodny, Krasnoyarsk, 660041, Russia | en |
Контакты автора | Litovka, Yuliya A.: V.N. Sukachev Institute of Forest FRC «Krasnoyarsk Sceince Center of the SB RAS» 50/28 Akademgorodok, Krasnoyarsk, 660036, Russia; Reshetnev Siberian State University of Science and Technology 31 Krasnoyarsky Rabochy, Krasnoyarsk, 660037, Russia | en |
Контакты автора | Ryazanova, Tatyana V.: Reshetnev Siberian State University of Science and Technology 31 Krasnoyarsky Rabochy, Krasnoyarsk, 660037, Russia | en |
Контакты автора | Chuprova, Nelli A.: Reshetnev Siberian State University of Science and Technology 31 Krasnoyarsky Rabochy, Krasnoyarsk, 660037, Russia | en |
Контакты автора | Litvinova, Ekaterina A.: Reshetnev Siberian State University of Science and Technology 31 Krasnoyarsky Rabochy, Krasnoyarsk, 660037, Russia | en |
Контакты автора | Putintseva, Yuliya A.: Siberian Federal University 79 Svobodny, Krasnoyarsk, 660041, Russia | en |
Контакты автора | Kües, Ursula: Georg-August-University of Göttingen 2 Büsgenweg, D-37073, Göttingen, Germany | en |
Контакты автора | Krutovsky, Konstantin V.: Siberian Federal University 79 Svobodny, Krasnoyarsk, 660041, Russia; Georg-August-University of Göttingen 2 Büsgenweg, D-37073, Göttingen, Germany; Texas A&M University College Station TX 77843, USA; N.I. Vavilov Institute of General Genetics RAS 3 Gubkina Str., Moscow, 119991, Russia; konstantin.krutovsky@forst.uni-goettingen.de | en |
Контакты автора | Павлов, И.Н.:Институт леса им. В.Н. Сукачева ФИЦ «Красноярский научный центр СО РАН» Россия, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/28; Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, Свободный, 79 | ru_RU |
Контакты автора | Литовка, Ю.А.: Институт леса им. В.Н. Сукачева ФИЦ «Красноярский научный центр СО РАН» Россия, 660036, Красноярск, Академгородок, 50/28; Сибирский государственный университет науки и технологий им. академика М.Ф. Решетнева Россия, 660037, Красноярск, пр. имени газеты «Красноярский рабочий» | ru_RU |
Контакты автора | Рязанова, Т.В.: Сибирский государственный университет науки и технологий им. академика М.Ф. Решетнева Россия, 660037, Красноярск, пр. имени газеты «Красноярский рабочий» | ru_RU |
Контакты автора | Чупрова, Н.А.: Сибирский государственный университет науки и технологий им. академика М.Ф. Решетнева Россия, 660037, Красноярск, пр. имени газеты «Красноярский рабочий» | ru_RU |
Контакты автора | Литвинова, Е.А.: Сибирский государственный университет науки и технологий им. академика М.Ф. Решетнева Россия, 660037, Красноярск, пр. имени газеты «Красноярский рабочий» | ru_RU |
Контакты автора | Путинцева, Ю.А.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, Свободный, 79 | ru_RU |
Контакты автора | Кюс, У.: Гёттингенский университет им. Георга-Августа Германия, 37073, Гёттинген, ул. Бёсгенвег, 2 | ru_RU |
Контакты автора | Крутовский, К.В.: Сибирский федеральный университет Россия, 660041, Красноярск, Свободный, 79; Гёттингенский университет им. Георга-Августа Германия, 37073, Гёттинген, ул. Бёсгенвег, 2; Техассий университет A&M США, TX 77843, Техас, Колледж-Стейшкен; Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН Россия, 119991, Москва, ул. Губкина, 3 | ru_RU |
Страницы | 30-48 | |
Журнал | Журнал Сибирского федерального университета.Биология. Journal of Siberian Federal University. Biology 2018 11(1) | en |