Изучение вклада транскриптомной регуляции отдельных гомеологов в стрессовый ответ у пшеницы мягкой

Abstract

Цель работы – Изучить вклад транскриптомной регуляции отдельных гомеологов в стрессовый ответ у пшеницы мягкой на основе массового анализа транскиптомных экспериментов, которые доступны для этого вида в GEO NCBI. В геноме пшеницы мягкой были идентифицированы 31458 групп генов являющиеся ортологами для других злаковых растений, среди них 15339 групп содержит ровно 3 гомеологичных гена. По данным выбранных экспериментов в ответ на засуху устойчиво экспрессируются 2855 генов, на понижение температуры – 12492 генов, на повышение температуры – 176 генов. Холодовой стресс тесно связан с накоплением сахаров. При рассмотрении связанных с данными генами функций, большая часть генов отвечает за метаболизм различных органических соединений; гетероциклических соединений, производных углеводов и активность гидролазы. В гомеологичных группах гены пшеницы дифференциально экспрессирующиеся в ответ на стресс относятся ко всем трем субгеномам, однако доля генов, относящихся к D геному преобладает достоверно для ответа на засуху.