Eight-cluster genome structure in chloroplasts of terrestrial plants

Abstract

Исследована внутренняя структурированность геномов хлоропластов и цианобактерий, показано, что эта структурированность существенно отличается от ранее обнаруженной для бактериальных геномов. Установлено, что $\mathsf{GC}$-контент не является ведущим фактором для тех структур, которые выявлены нами в геномах хлоропластов. Под структурированностью понимается кластеризация частотных словарей триплетов отдельных фрагментов генома, определяемых регулярным порядком, вне зависимости от функциональной роли того или иного участка. Кластеризация проводилась методом упругих карт.